能源计量研究所主要负责能源计量专业领域的技术研究、开发与应用，开展节能减排相关技术咨询与测试服务工作：绿色制造体系（绿色工厂、绿色供应链、绿色产品、绿色园区）创建咨询、能源审计、碳排放核查、用能权核查、节水型企业认证；水平衡测试、锅炉及通用设备（电机、风机、水泵、空压机等）能效测试等。该所以能源计量及碳排放数据在线监测平台为基础，以数据分析、应用为载体，为加强政府能源计量管理、促进企业节能低碳绿色发展、助力福建省能耗“双控”、“双碳”目标实现等节能低碳工作提供有效服务，建有全国首个“国家城市能源计量中心（福建）”、工信部“工业节能与绿色发展评价中心”。
